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提取RNA如何保存才能防止RNase污染。

更新時間:2020-08-11      瀏覽次數:6352

提取RNA如何保存才能防止RNase污染。

 

提取RNA或重復使用樣品時,可能會引入少量的RNase污染。正確的存儲可以減少RNase污染和隨之而來的樣品降解。有幾個可供選擇的用于存儲純化RNA的方法。
●用水性緩沖液溶解沉淀并存儲于-80℃。常用緩沖液包括TE ( 10mmol/L Tris-HCl,1 mmol/L EDTA, pH 7.0),含SDS (0.1%~0.5%)的TE (pH7.6),含有0.1mmol/LEDTA(pH7.5)的DEPC處理水,或商品化的RNA儲存液(如RNA儲存液,Ambion)。RNA在-80℃下可穩定保存1年。EDTA是一種鎂和其他金屬離子的螯合劑,可以避免這些金屬離子對RNA的非特異性降解;使用EDTA溶液要保證無RNase。SDS是一種核酸酶抑制劑:在用RNA作為模板之前,如用于引物延伸反應、反轉錄或體外翻譯時,應用lv仿抽提和標準乙醇沉淀法去除SDS。
●用鹽/乙醇混懸液( salt/ethanol slurry) 在-80℃下儲存RNA。將RNA按標準沉淀步驟沉淀,即鹽(1/10體積的3mol/L乙酸鈉)和乙醇(2倍體積的100%乙醇)在-80°C下存儲該混合物,不需要通過離心沉淀RNA。低pH、高乙醇含量及低溫的結合將穩定RNA并抑制酶活性,這是長期儲存RNA的shou選方法。當需要時,可以使用自動移液裝置回收RNA樣品。然而,由于沉淀的RNA是塊狀并有黏性,黏在一次性吸頭表面上會造成部分損失,導致RNA的回收量損失。可以離心得到RNA沉淀,并溶解在水溶性緩沖液,然后再吸取。
●用去離子甲酰胺溶解沉淀,并儲存于-20°C。在這種條件下,RNA至少可以穩定保存1年( Chomczynski 1992)。 甲酰胺提供了穩定的化學環境,可保護RNA不被RNA酶降解。甲酰胺可以很快溶解純的無鹽RNA,濃度可大于4mg/mL,這樣濃度的RNA樣品可以直接進行凝膠電泳、RT-PCR或RNase保護分析,既省時又避免了潛在因素的降解。如果需要,用4倍體積的乙醇進行沉淀,如Chomczynski (1992)所述,或用0.2mol/L NaCl 4倍稀釋甲酰胺,然后加入常規2倍體積的乙醇(Nadin-Davis and Mezl 1982)可以回收溶于甲酰胺溶液中RNA.
當從存儲狀態回收RNA樣品時,是在冰上解凍樣品,以避免被RNase降解。此外建議按使用量分裝RNA,這樣可避免反復凍融對RNA的損傷,并可防止RNase污染。

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